1、教学理论上的区别：藏传佛教多争论中观和瑜伽的修行，即有门派和空门派。藏传佛教除了明确的请教之外，还有密宗请教。汉传佛教基本上是真空中的奇妙统一，而大乘八大门派基本上调和了空的观点。

2、佛法修行方式不同：在藏传佛教信徒中，密咒(亦称真言，如“om it，米白包书，砍胺门”。喇嘛教中的请教礼仪，如祈祷轮和跪在山上，也是独一无二的。在汉传佛教中，念诵“南无阿弥陀佛”的净土法(净土宗)较为常见，有禅宗、居士宗、石成宗、法华宗、性空宗、法香宗、华严宗。

3、喇嘛教更注重讲学的说法：藏传佛教有非常完整的听、想、说、辩体系，一直非常重视传承，从未间断，每次都要求学习。特别是西藏有很多寺院。比如我住的塞尔达县，就有20多座寺院，人口不到5万。这些寺院都是arihoshi教的，周围的人也经常听。与汉传佛教形成对比的是，一个城市的寺院很少，即使有几个，也没有多少传道授业解惑的现象。其实现在很多佛教徒都很虔诚，只是大部分人不明白佛教里说的是什么。

4、与印度佛教的关系不同：藏传佛教与后期印度佛教关系密切。另一方面，藏传佛教是从印度佛教发展后期传入吐蕃地区的。汉传佛教接近印度佛教中期的样子。佛教在印度发展，四处传播。发展到大乘中期，恰好丝绸之路大规模向中原蔓延。继承制度不同。