并不存在毛囊炎用什么药物最好的说法。毛囊炎可以使用醋酸氯己定溶液、莫匹罗星软膏、头孢呋辛酯颗粒、硝酸咪康唑乳膏、伊曲康唑胶囊等药物。

1、醋酸氯己定溶液：早期患者可以使用此类药物进行擦拭患处，能够抑制病原体，减轻皮肤炎症。

2、莫匹罗星软膏：如果是细菌感染所引起的毛囊炎，可以外涂莫匹罗星软膏，能够杀灭、抑制细菌，减轻炎症。

3、头孢呋辛酯颗粒：针对细菌感染引起的毛囊炎，若皮肤损伤较大，或者是出现反复发作、外用药物效果不佳时，可以遵医嘱口服头孢呋辛酯颗粒，能够减轻感染症状。

4、硝酸咪康唑乳膏：如果是真菌感染引起的毛囊炎，可以外涂硝酸咪康唑乳膏，能够抑制真菌，减轻炎症。

5、伊曲康唑胶囊：感染真菌后引起毛囊炎，症状较为严重时，可以遵医嘱口服伊曲康唑胶囊，能够起到杀菌作用。

建议患者及时到医院皮肤科就医，确定病因之后在医生指导下正确用药。